"A verdade está lá fora". O crédulo Fox Mulder e a cética Dana Scully são agentes do FBI especializados em resolver arquivos-x, casos não solucionados com possíveis envolvimentos paranormais, alienígenas e sobrenaturais. Mulder, na verdade, tenta encontrar sua irmã abduzida. Scully foi designada por superiores para tentar invalidar os arquivos-x como bobagem, mas com o desenrolar dos fatos, passa a dar cada vez mais razão a Mulder. Com o tempo, os dois percebem que o alto escalão governamental e militar americano esconde segredos terríveis e que não podem confiar em ninguém.