A tempestuosa Mary Lennox (Margaret O’Brien), nascida na Índia de pais ricos, fica órfã por uma epidemia de cólera, ela então é enviada para viver com o recluso e amargurado tio Archibald Craven (Herbert Marshall) e seu primo acamado e mal comportado Colin (Dean Stockwell) em sua propriedade desolada e decadente conhecida como Misselthwaite Manor. Dickon (Brian Roper), o irmão de uma das empregadas da casa, conta para ela sobre a existência de um jardim secreto e misterioso, por trás de uma porta escondida em uma parede coberta de trepadeiras.