O jovem Akira descobre que o planeta Icarus está em rota de colisão com a terra, mas antes que possa relatar a notícia é sequestrado por agentes do governo, que o levam a instalação secreta do Dr. Yamatone nos alpes japoneses, lá Yamatone diz a Akira que precisa de sua ajuda, para encontrar um diamante especial, que dará a força necessária a sua nova arma de raios, a única com poder para destruir Icarus.